Si quieres ver películas en formato DIVX, XVID o WMV puedes hackear tu Apple TV o bien puedes cambiar el formato de las mismas. Si eres más conservador y no te sientes cómodo ante la idea de desmontar tu flamante Apple TV, puedes usar unas acciones de Automator con Quicktime para realizar el cambio de formato a tus películas.
Eso sí es una opción más segura pero también es más lenta. Setting up an automated workflow to convert files for Apple TV on OS X (Vía TUAW)